Rakkude vakuolatsioon viitab erineva suurusega vakuoolide (vesiikulite) ilmnemisele degenereerunud rakkude tsütoplasmas ja tuumas ning rakud on rakulised või retikulaarsed.Sellel olukorral on palju põhjuseid.Saame vähendada rakkude vakuoleerumistrakukultuuri kolbnii vähe kui võimalik igapäevaste toimingute kaudu.
1. Kinnitage raku olek: määrake rakkude olek enne rakkude kultiveerimist ja proovige valida kultiveerimiseks suurima põlvkonna arvuga rakud, et vältida vakuoole, mis on tingitud rakkude vananemisest kultiveerimisprotsessi ajal.

2. Määrake söötme pH väärtus: kinnitage söötme pH sobivus ja rakkudele vajalik pH, et vältida rakkude kasvu mõjutamist ebasobiva pH tõttu.
3. Kontrollige trüpsiini seedimisaega: subkultuuris valige sobiv trüpsiini kontsentratsioon ja seedimiseks sobiv seedimise aeg ning vältige operatsiooni ajal liiga palju õhumulle.
4. Jälgige rakkude olekut igal ajal: Rakkude kultiveerimisel jälgige rakukultuuri kolvis rakkude olekut igal ajal, et tagada rakkude piisav toitainete vajadus ja vältida rakkude vakuoliseerumist toitainete defitsiidi tõttu.
5. Proovige kasutada hea kvaliteediga ja korrapäraste kanalitega veise loote seerumit, kuna selline seerum on toitaineterikas ja sellel on vähe eksogeenseid stimuleerivaid tegureid, mis võivad selliseid probleeme tõhusalt vältida.
Ülaltoodud toimingud võivad vähendada rakkude vakuoleerumist rakukultuuri kolvis.Lisaks tuleks operatsiooni ajal rangelt järgida steriilsusnõudeid, et vähendada mitmesuguse saastumise võimalust.Kui leitakse, et rakud on saastunud, tuleb need õigeaegselt ära visata, et vältida hilisemate katsete mõjutamist.